Troisième grande fédération aux côtés du RMF (Rassemblement des musulmans de France) et la GMP (Grande mosquée de Paris), l’UOIF a appelé à boycotter la consultation du 8 juin pour le renouvellement des instances du Conseil français du culte musulman après un désaccord avec la GMP sur deux régions que cette dernière a refusé de lui céder. Son appel a été suivi dans 22 régions sur un total de 25.
L’assemblée générale élective de l’Union des organisations islamiques de France (UOIF) s’est réunie le 1er et 2 Juin 2013 et a élue un nouveau conseil d’administration pour un mandat de quatre ans. Suite à cette élection, le nouveau Conseil d’Administration de l’UOIF, réuni dimanche, a procédé à l’élection de M. Amar Lasfar, au poste de président de cette organisation, proche des frères musulmans.